在心肌相关疾病方面，磷酸肌酸二钠盐发挥着不可或缺的作用，它可以改善心肌缺血部位的微循环，从而提高心肌的能量水平，是一种心肌保护剂，例如在心肌梗塞、心肌肥厚以及心脏衰竭等疾病中，可作为辅助药物使用。在心脏手术时，加入心脏停搏液中，能保护心肌缺血状态下的心肌代谢异常，此时心脏停搏液中的浓度要求为10尘尘辞濒/尝。
磷酸肌酸二钠盐具有稳定细胞的功效，可以避免细胞受到损害，维持细胞的正常功能并且具有抗氧化效果。这有助于保护机体细胞免受各种损伤因素的影响，对于维持身体内环境稳定具有积极意义。
它还具有抗血小板聚集的作用，有助于调节体内的血液循环，通过血小板的聚集，能够防止血栓形成，维持血管内血液的正常流动状态，有助于减少心血管疾病发生的风险，在体育运动中，磷酸肌酸二钠盐是运动员的运补剂。因为它可以增加运动员的体能，提高运动成绩，并且安全有效无副作用。对于参与竞技运动的运动员来说，在比赛中它的增加能提高训练和比赛成绩。这主要是因为磷酸肌酸二钠盐能够参与能量运输，即将能量从线粒体运送到肌肉的其他部位，为肌动球蛋白收缩过程提供能量，在肌肉收缩的能量代谢中发挥着重要作用。而且在大强度练习时，磷酸肌酸二钠盐在合成础罢笔过程中需要消耗堆积在肌肉中乳酸释放出来的氢离子，从而起到缓冲肌肉中酸性物质突然增高的作用，能够缓冲推迟疲劳产生。
不同个体之间存在着身体代谢方面的差异，这包括对磷酸肌酸二钠盐的吸收、代谢和排泄速度的不同。例如一些人的肝肾功能较好，对药物的代谢和排泄能力强，相对而言可能更容易耐受较高剂量的磷酸肌酸二钠盐；而另一些人可能代谢和排泄功能欠佳，就需要更低的剂量来避免药物在体内的蓄积及其产生的不良影响。
